RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 M0QZ24 198 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 PDE6DO43924 150 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 COX5AP20674 150 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 GFRA1P56159 465 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF90Q03938 601 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 TFF3Q07654 80 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 Q0VG73 95 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 FBLN7Q53RD9 439 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 STRADBQ9C0K7 418 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 CEP250Q9BV73 2442 aa20.67■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 MMP23AO75900 390 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 OR4C5Q8NGB2 326 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 CBY3A6NI87 242 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 CLDN1O95832 211 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 PPBPP02775 128 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 THBS3P49746 956 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 NRN1Q9NPD7 142 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 C5orf49A4QMS7 147 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 CTXN2P0C2S0 81 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 BCL3P20749 454 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 KRTCAP3Q53RY4 240 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 OR2W1Q9Y3N9 320 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 FCN1O00602 326 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 GPM6AP51674 278 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 MORN2Q502X0 79 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 VASH2Q86V25 355 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 ZPBPQ9BS86 351 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 GNB4Q9HAV0 340 aa20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 DNPH1O43598 174 aa20.64■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 TIMP3P35625 211 aa20.64■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 MAGEA5P43359 124 aa20.64■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 OR10G8Q8NGN5 311 aa20.64■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 FAM122AQ96E09 287 aa20.64■□□□□ 0.9
PKDCC-201ENST00000294964 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 TM4SF5O14894 197 aa20.64■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 MT-CO3P00414 261 aa20.64■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 NGFP01138 241 aa20.64■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 HES3Q5TGS1 186 aa20.64■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 OR2D3Q8NGH3 330 aa20.64■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 NEURL1O76050 574 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 SERPINA7P05543 415 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 TSPOP30536 169 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 IER3P46695 156 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 OR1L1Q8NH94 360 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 RDH5Q92781 318 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM147Q9BVK8 224 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 WNT10AQ9GZT5 417 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf172C9J069 976 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF253O75346 499 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 BET1LQ9NYM9 111 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 SLC17A3O00476 420 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 AMTP48728 403 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF488Q96MN9 340 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 NPCDR1Q9BY65 106 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 PCBD1P61457 104 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 RPS16P62249 146 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF585BQ52M93 769 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 SMIM15Q7Z3B0 74 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 KCNIP2Q9NS61 270 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 RNF24Q9Y225 148 aa20.62■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 SNURFLB1AK76 121 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 OR2M7Q8NG81 312 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 VPS25Q9BRG1 176 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A10PA6NDY2 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A18PA6NE21 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A16PA6NEW6 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A7PA6NKC0 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A22PA8MWA6 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A12PA8MX19 464 aa20.61■□□□□ 0.89
PKDCC-201ENST00000294964 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms