RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BCP62807 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 MZT1Q08AG7 82 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ADIRFQ15847 76 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 YPEL2Q96QA6 119 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.89■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 B4DEV8 164 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 IFNA1P01562 189 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CFHR2P36980 270 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CR1LQ2VPA4 569 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 C4orf17Q53FE4 359 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GFI1BQ5VTD9 330 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 OR4F5Q8NH21 305 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 OR4F4Q96R69 305 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SMCO3A2RU48 225 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 F2RL2O00254 374 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PAGE4O60829 102 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 IFNA10P01566 189 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 S100A9P06702 114 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SMIM6P0DI80 62 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 Q6ZS92 163 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 OR4A16Q8NH70 328 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM210BQ96KR6 192 aa15.88■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CLDN34H7C241 214 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CD1BP29016 333 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RTP5Q14D33 572 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF709Q8N972 641 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 NECAP1Q8NC96 275 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GCM1Q9NP62 436 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PCNX1Q96RV3 2341 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RELNP78509 3460 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CGB3P0DN86 165 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CGB7P0DN87 165 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 MYOD1P15172 320 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PSMB3P49720 205 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RELBQ01201 579 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PARLQ9H300 379 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM140Q9NV12 185 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.87■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 MMP23AO75900 390 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HOXA5P20719 270 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 FRZBQ92765 325 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 S1PR3Q99500 378 aa15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 NPPCP23582 126 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RND2P52198 227 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TCF23Q7RTU1 214 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PPP1R35Q8TAP8 253 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CCL13Q99616 98 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV1-46P01743 117 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 MBP02144 154 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 PMS2P11Q13670 270 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM241Q24JQ0 296 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM216BQ8N7L0 139 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 OR51G1Q8NGK1 321 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 DDB2Q92466 427 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 NAT8Q9UHE5 227 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 ACACAQ13085 2346 aa15.85■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GFRA3O60609 400 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 KBTBD11O94819 623 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GYPAP02724 150 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TRGC1P0CF51 173 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 UBE2G2P60604 165 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 SPCS3P61009 180 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 TREML4Q6UXN2 200 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 KLK10O43240 276 aa15.84■□□□□ 0.13
LPCAT3-201ENST00000261407 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms