RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	BI4	P03879	638 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	CKA2	P19454	339 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	TKL2	P33315	681 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	NUP60	P39705	539 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	GCN5	Q03330	439 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	PRM6	Q04705	352 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	GPM2	Q12008	311 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	REV1	P12689	985 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	ALG1	P16661	449 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	MRPL33	P20084	86 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.28	□□□□□ -1.4	not detected
SYF2	YGR129W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.28	□□□□□ -1.4	RIP-Chip
SYF2	YGR129W	PET10	P36139	283 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	AGP2	P38090	596 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	PPX1	P38698	397 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	PIK1	P39104	1066 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	GDH3	P39708	457 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	OSW5	P40219	148 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	SMA1	Q02651	245 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	DCS2	Q12123	353 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF2	YGR129W	MRP10	O75012	95 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	VMA3	P25515	160 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	RRM3	P38766	723 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	NPA3	P47122	385 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YCG1	Q06680	1035 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YBR225W	P38321	900 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	DYS1	P38791	387 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	RTC4	P53850	401 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YNL011C	P53980	444 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	TOF2	Q02208	771 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	PTC5	Q12511	572 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	AI3	P03877	415 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	MSF1	P08425	469 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	SFP1	P32432	683 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	KDX1	P36005	433 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	SRX1	P36077	127 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	ATG12	P38316	186 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	NPP2	P39997	493 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YER158C	P40095	573 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	BUD6	P41697	788 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	THI6	P41835	540 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	UBA2	P52488	636 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YNR065C	P53751	1116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	CHS1	P08004	1131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	FRE1	P32791	686 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YEL1	P34225	687 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YBR197C	P38306	217 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	WSC4	P38739	605 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	AVT2	P39981	480 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	HEM14	P40012	539 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	DAS1	P47005	663 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YPL277C	Q08989	487 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YPR027C	Q12079	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	FOB1	O13329	566 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	PHO8	P11491	566 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	PUP1	P25043	261 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	PPS1	P38148	807 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YHL017W	P38745	532 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YPS6	P40583	537 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	YPL014W	Q02606	381 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	MUB1	Q03162	620 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	CSF1	Q12150	2958 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	DAL7	P21826	554 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	RML2	P32611	393 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	ISC10	P32645	267 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	UME6	P39001	836 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	FHL1	P39521	936 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	DAK2	P43550	591 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	COQ6	P53318	479 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SYF2	YGR129W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SAC7	P17121	654 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	DSS4	P32601	143 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.21	□□□□□ -1.42	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 84 ms