RNA–Protein interactions for RNA: Q0017

Q0017, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0017, Length 162 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0017	Q0017	TIM50	Q02776	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	GEP3	Q08622	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	YIP4	P53093	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	TFB2	Q02939	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	ORM2	Q06144	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	PPE1	P38796	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	PXA1	P41909	870 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	BFA1	P47113	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	SPO1	P53541	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	STP4	Q07351	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	ZPS1	Q12512	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	TUP1	P16649	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	PMA2	P19657	947 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	THI6	P41835	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	ATP23	P53722	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	MFM1	Q02783	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	MRPL7	P36519	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	TDA3	P38758	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	YNL193W	P53870	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	BEM3	P32873	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	PIH1	P38768	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
Q0017	Q0017	MEP2	P41948	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0017	Q0017	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	SWI6	P09959	803 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	AQY1	P0CD91	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	FDC1	Q03034	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	IRC3	Q06683	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	MGS1	P40151	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	RET2	P43621	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	BUD17	P53727	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	PPN1	Q04119	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	PRE4	P30657	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	FTR1	P40088	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	YJL043W	P47053	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	YNL018C	P53976	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	YPL068C	Q02749	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	CNE1	P27825	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	MRPL9	P31334	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	DUN1	P39009	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	OSW7	P43611	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	COQ6	P53318	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	CDS1	P38221	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	TAF4	P50105	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
Q0017	Q0017	YDL073W	Q07454	984 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	RPC34	P32910	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	NMD5	P46970	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	ATG36	P46983	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	YJR096W	P47137	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	PRM2	P40534	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	IES1	P43579	692 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	RSC9	Q03124	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Q0017	Q0017	WHI2	P12611	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	SEC65	P29478	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	EHT1	P38295	451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	CKB2	P38930	258 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YFL015C	P43578	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YGR153W	P48238	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	HLR1	Q04429	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	BST1	P43571	1029 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
Q0017	Q0017	EXO1	P39875	702 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	SNO3	P43544	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	IRC8	P47046	822 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	NSE5	Q03718	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	HOP1	P20050	605 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YHR033W	P38690	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	HXT7	P39004	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YEL025C	P39991	1188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	SAP4	P53036	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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