RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 A1BGP04217 495 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 BRAPQ7Z569 592 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 XAGE2Q96GT9 111 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 ARMT1Q9H993 441 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 NOD1Q9Y239 953 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DACT1Q9NYF0 836 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 IL13P35225 146 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 G2E3Q7L622 706 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 TNNQ9UQP3 1299 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDP1-208ENST00000613122 NIM1KQ8IY84 436 aa22.83■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 LGR6Q9HBX8 967 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CEP83Q9Y592 693 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CHMLP26374 656 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ALDH1B1P30837 517 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 FERP16591 822 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 LETM2Q2VYF4 491 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 GJC1P36383 396 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ARID5AQ03989 594 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ATP7AQ04656 1500 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 B4E1Z4 1266 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 LPIN2Q92539 896 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 PLIN2Q99541 437 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 TAF5LO75529 589 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 IQUBQ8NA54 791 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 NEK11Q8NG66 645 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM87BQ96K49 555 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC175P0C221 793 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CTR9Q6PD62 1173 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.8■■□□□ 1.24
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CTDP1-208ENST00000613122 ERICH4A6NGS2 130 aa22.79■■□□□ 1.24
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CTDP1-208ENST00000613122 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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CTDP1-208ENST00000613122 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 RLBP1P12271 317 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 APPBP2Q92624 585 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 TACC1O75410 805 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 PRKG1Q13976 671 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CEP135Q66GS9 1140 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ZBED4O75132 1171 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP2AO43633 222 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF174Q15697 407 aa22.77■■□□□ 1.24
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CTDP1-208ENST00000613122 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 SNX21Q969T3 373 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 DEXIO95424 95 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.77■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.77■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN1Q04323 297 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CEP112Q8N8E3 955 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 SMTNP53814 917 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 KRT83P78385 493 aa22.76■■□□□ 1.23
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