RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.62	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.62	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.62	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.62	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.61	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	TRAF5	O00463	557 aa		27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CST9	Q5W186	159 aa		27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	TEKT1	Q969V4	418 aa		27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.59	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CRK	P46108	304 aa		27.58	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		27.58	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.58	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.57	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.57	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.57	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	IGSF3	O75054	1194 aa		27.56	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.56	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	AACS	Q86V21	672 aa		27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	MAP2K2	P36507	400 aa		27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	GRM1	Q13255	1194 aa		27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	GRIK5	Q16478	980 aa		27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	SLF2	Q8IX21	1173 aa		27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.54	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.53	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.53	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	MCAM	P43121	646 aa		27.52	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.52	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.52	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.52	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.52	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	ABCF2	Q9UG63	623 aa		27.52	■■■□□ 2
APBA3-208	ENST00000592826	APBB1	O00213	710 aa		27.51	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	PRDX5	P30044	214 aa		27.51	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.51	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.51	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.5	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.5	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	NF2	P35240	595 aa		27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	FKBP1B	P68106	108 aa		27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.49	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.48	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.48	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	CA12	O43570	354 aa		27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	TNNI2	P48788	182 aa		27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	GSTO1	P78417	241 aa		27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.46	■■□□□ 1.99
APBA3-208	ENST00000592826	AOC2	O75106	756 aa		27.45	■■□□□ 1.98
APBA3-208	ENST00000592826	LDHC	P07864	332 aa		27.45	■■□□□ 1.98
APBA3-208	ENST00000592826	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.45	■■□□□ 1.98
APBA3-208	ENST00000592826	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		27.45	■■□□□ 1.98
APBA3-208	ENST00000592826	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		27.44	■■□□□ 1.98
APBA3-208	ENST00000592826	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.44	■■□□□ 1.98
APBA3-208	ENST00000592826	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.44	■■□□□ 1.98

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