RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	WNT11	O96014	354 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	USP11	P51784	963 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	NEFL	P07196	543 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	CTSB	P07858	339 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	MAOB	P27338	520 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	PAOX	Q6QHF9	649 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	SHISA5	Q8N114	240 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	NDUFB5	O43674	189 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	CYP11A1	P05108	521 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	ADH5	P11766	374 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	ORC1	Q13415	861 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	POU4F3	Q15319	338 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	B3GALT4	O96024	378 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	FOSL1	P15407	271 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ITPKA	P23677	461 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	PDE3B	Q13370	1112 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	PAX4	O43316	350 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ADM	P35318	185 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	EHD4	Q9H223	541 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ECEL1	O95672	775 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	IGHA2	P01877	340 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	GATA6	Q92908	595 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	GPR182	O15218	404 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	NFIC	P08651	508 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	DYM	Q7RTS9	669 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	PRNP	P04156	253 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	RAB6A	P20340	208 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	MAP7	Q14244	749 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ZNF559-209	ENST00000591652	CYP26A1	O43174	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	AOC2	O75106	756 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	AP3B2	Q13367	1082 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	TXK	P42681	527 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	ASPA	P45381	313 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	ABI1	Q8IZP0	508 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	TMC1	Q8TDI8	760 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ZNF559-209	ENST00000591652	PDE3A	Q14432	1141 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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