RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		21.42	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		21.42	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYM6	O95789	1325 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CLIC4	Q9Y696	253 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	MYH3	P11055	1940 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	PDE8B	O95263	885 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		21.41	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GVL5	298 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	GPT	P24298	496 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA8	P51970	172 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	HLF	Q16534	295 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	PDE8A	O60658	829 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	ANO1	Q5XXA6	986 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM87B	Q96K49	555 aa		21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
RRN3-205	ENST00000563559	CMA1	P23946	247 aa		21.39	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA2	P54652	639 aa		21.39	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		21.39	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		21.39	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		21.39	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	APP	P05067	770 aa		21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SYNE4	Q8N205	404 aa		21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ALX1	Q15699	326 aa		21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	AK7	Q96M32	723 aa		21.38	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SMTNL1	A8MU46	457 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	GSDMD	P57764	484 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC102B	Q68D86	513 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	JMY	Q8N9B5	988 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	LPIN2	Q92539	896 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF3	Q9H094	633 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	LRP6	O75581	1613 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TPM4	P67936	248 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB4	P16144	1822 aa		21.37	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	C4A	P0C0L4	1744 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	C4B	P0C0L5	1744 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	BCL9	O00512	1426 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TNNT1	P13805	278 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	PDE6A	P16499	860 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A14	Q15043	492 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TIGD1	Q96MW7	591 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		21.36	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF202	O95125	648 aa		21.35	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	APOA5	Q6Q788	366 aa		21.35	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	AIDA	Q96BJ3	306 aa		21.35	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ALG1	Q9BT22	464 aa		21.35	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	KIF28P	B7ZC32	967 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SYCP1	Q15431	976 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB43	O43298	467 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	PPP6R2	O75170	966 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	SKIL	P12757	684 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	PHKA1	P46020	1223 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP12	P59046	1061 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TSC1	Q92574	1164 aa		21.34	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	LIFR	P42702	1097 aa		21.33	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K12	Q12852	859 aa		21.33	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM29	Q14134	588 aa		21.33	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	VPS37D	Q86XT2	251 aa		21.33	■■□□□ 1.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC69	A6NI79	296 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A1	P13866	664 aa		21.32	■■□□□ 1

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