RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 RGPD5Q99666 1765 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PAPPAQ13219 1627 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SIN3BO75182 1162 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 INHAP05111 366 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SELPP16109 830 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SCNN1DP51172 638 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 GDF10P55107 478 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 LAMC2Q13753 1193 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PRAM1Q96QH2 718 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 CHD4Q14839 1912 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PAX4O43316 350 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 GPR37L1O60883 481 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ELNP15502 786 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SMTNP53814 917 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PIK3C2AO00443 1686 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 CEP350Q5VT06 3117 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 COL18A1P39060 1754 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 TXKP42681 527 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 LCE1DQ5T752 114 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 MAFGO15525 162 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ADH7P40394 386 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PSME1Q06323 249 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 TNFRSF25Q93038 417 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 SLC30A3Q99726 388 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 CABP1Q9NZU7 370 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 USP3Q9Y6I4 520 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 NHSQ6T4R5 1651 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0A0MRY4 1105 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB7AO95365 584 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 MCCP23508 829 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 RNF112Q9ULX5 631 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.4□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 BTAF1O14981 1849 aa7.4□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SIRT1Q96EB6 747 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SLIT3O75094 1523 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 CDK2AP1O14519 115 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 LILRB5O75023 590 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 TXLNAP40222 546 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 ANAPC15P60006 121 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 RAC1P63000 192 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 KCNQ2O43526 872 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 NEFMP07197 916 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms