RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1-218ENST00000556262 PRKAB2O43741 272 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 DTNBO60941 627 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 NPR1P16066 1061 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PDE6BP35913 854 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 Q6ZUG5 572 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 POLLQ9UGP5 575 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF213O14771 459 aa22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 OLFM4Q6UX06 510 aa22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 NECAB1Q8N987 351 aa22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ATP2B4P23634 1241 aa22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ANKRD1Q15327 319 aa22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 PRDX5P30044 214 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ST3GAL1Q11201 340 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 CHST3Q7LGC8 479 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 SP8Q8IXZ3 490 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 NBPF3Q9H094 633 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 NUCB2P80303 420 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 MECOMQ03112 1051 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.12■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 C6orf229H3BNL8 230 aa22.11■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 TMC4Q7Z404 712 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 BRF1Q92994 677 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 MASTLQ96GX5 879 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 GBP4Q96PP9 640 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ALDH1B1P30837 517 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 FGD1P98174 961 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 STK3Q13188 491 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ALX1Q15699 326 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 NAPBQ9H115 298 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 LTBP1Q14766 1721 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.09■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 CD209Q9NNX6 404 aa22.09■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 GNAT2P19087 354 aa22.08■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.08■■□□□ 1.13
SDR39U1-218ENST00000556262 ZBTB22O15209 634 aa22.08■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.08■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.08■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 TDO2P48775 406 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 GRIK5Q16478 980 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 INCENPQ9NQS7 918 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 RIMBP2O15034 1052 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 CHRNA5P30532 468 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 NCOA7Q8NI08 942 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 ZMYM6O95789 1325 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 H0YIN7 160 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 IL1R1P14778 569 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 APOBRQ0VD83 1088 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 TRAK2O60296 914 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 GJB2P29033 226 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 MPNDQ8N594 471 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 PRC1O43663 620 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 MCM5P33992 734 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 ANTXR2P58335 489 aa22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SDR39U1-218ENST00000556262 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.05■■□□□ 1.12
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