RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555350.1

LINC00645-201, long intergenic non-protein coding RNA 645, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00645, Length 470 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 NPHS2Q9NP85 383 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 NDUFB5O43674 189 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 ECEL1O95672 775 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 F13BP05160 661 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 ADH5P11766 374 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 MAOBP27338 520 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 FAM129BQ96TA1 746 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 USP11P51784 963 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 NFKBIBQ15653 356 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 ZNF576Q9H609 170 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 PIM2Q9P1W9 311 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 GPR182O15218 404 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 ADMP35318 185 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 IRAK1P51617 712 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 POU4F3Q15319 338 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 PAOXQ6QHF9 649 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 RETREG2Q8NC44 543 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 EHD4Q9H223 541 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 ATG3Q9NT62 314 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00645-201ENST00000555350 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 B3GALT4O96024 378 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 IGHA2P01877 340 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 RAB6AP20340 208 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CYP11A1P05108 521 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ITPKAP23677 461 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 PDE3BQ13370 1112 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 MSMPQ1L6U9 139 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CORO1BQ9BR76 489 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ABCB6Q9NP58 842 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 FAM170BA6NMN3 283 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 WNT11O96014 354 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 NEFLP07196 543 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 NFICP08651 508 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 FOSL1P15407 271 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 DYMQ7RTS9 669 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ZAR1Q86SH2 424 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 TMC1Q8TDI8 760 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 GATA6Q92908 595 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 RAD18Q9NS91 495 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 LCE3BQ5TA77 95 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 FAAP100Q0VG06 881 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 PDE3AQ14432 1141 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 WDR18Q9BV38 432 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 PAX4O43316 350 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 GRM2Q14416 872 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ABI1Q8IZP0 508 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CITED4Q96RK1 184 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 LGR6Q9HBX8 967 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00645-201ENST00000555350 CYP26A1O43174 497 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 AOC2O75106 756 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 ASPAP45381 313 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 MAP7Q14244 749 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 PI16Q6UXB8 463 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 CSRNP1Q96S65 589 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00645-201ENST00000555350 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms