RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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CTDSP2-204ENST00000548823 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
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CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDSP2-204ENST00000548823 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
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CTDSP2-204ENST00000548823 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.63■■□□□ 1.53
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CTDSP2-204ENST00000548823 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 OPTNQ96CV9 577 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 GREM2Q9H772 168 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDSP2-204ENST00000548823 GNAI3P08754 354 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 C8orf34Q49A92 452 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A0C4DFX4 3053 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTDSP2-204ENST00000548823 KLRK1P26718 216 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 MEIS3Q99687 375 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 PRO3102Q9H379 93 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 ELP3Q9H9T3 547 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 COL6A3P12111 3177 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 SPDYE6P0CI01 402 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 CERS5Q8N5B7 392 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 VEZTQ9HBM0 779 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDSP2-204ENST00000548823 OTOFQ9HC10 1997 aa24.58■■□□□ 1.53
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CTDSP2-204ENST00000548823 CEP85Q6P2H3 762 aa24.57■■□□□ 1.52
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CTDSP2-204ENST00000548823 CCL15Q16663 113 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.56■■□□□ 1.52
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CTDSP2-204ENST00000548823 PRMT2P55345 433 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 HMMRO75330 724 aa24.54■■□□□ 1.52
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CTDSP2-204ENST00000548823 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 TLR2O60603 784 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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CTDSP2-204ENST00000548823 KCNJ4P48050 445 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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CTDSP2-204ENST00000548823 KSR2Q6VAB6 950 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH1L1O75891 902 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 IGKV5-2P06315 115 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDSP2-204ENST00000548823 BEND3Q5T5X7 828 aa24.5■■□□□ 1.51
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