RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ABCA8O94911 1581 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SLC39A6Q13433 755 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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PDE4D-226ENST00000546160 NEK11Q8NG66 645 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ASIC1P78348 528 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CTR9Q6PD62 1173 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TMX3Q96JJ7 454 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CTAGE9A4FU28 777 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PLCD1P51178 756 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HACE1Q8IYU2 909 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IFT74Q96LB3 600 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TACC1O75410 805 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ADCY5O95622 1261 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TAF12Q16514 161 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 VWA3BQ502W6 1294 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TEX11Q8IYF3 940 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CEP112Q8N8E3 955 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC77Q9BR77 488 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TCHPQ9BT92 498 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CSRNP2Q9H175 543 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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PDE4D-226ENST00000546160 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PRG0 241 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TUBBP07437 444 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DCTPP1Q9H773 170 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 INSRP06213 1382 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KRT86O43790 486 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CLUL1Q15846 466 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SPTLC2O15270 562 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 AKR1B10O60218 316 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IQUBQ8NA54 791 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PZPP20742 1482 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CEP85Q6P2H3 762 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 BRF1Q92994 677 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KIF5AQ12840 1032 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM14Q14142 442 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 WDR44Q5JSH3 913 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ELP1O95163 1332 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ATP7BP35670 1465 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TNFAIP1Q13829 316 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SV2BQ7L1I2 683 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CEP63Q96MT8 703 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DEXIO95424 95 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 AFMP43652 599 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 EYA1Q99502 592 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CEP135Q66GS9 1140 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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PDE4D-226ENST00000546160 LPIN2Q92539 896 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 H7C1D1 291 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BIN1O00499 593 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 UFL1O94874 794 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TFCP2Q12800 502 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NIM1KQ8IY84 436 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA1Q92805 767 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 KDM6BO15054 1643 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ZBED4O75132 1171 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 VAMP4O75379 141 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA6P23229 1130 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 STRN3Q13033 797 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 APPBP2Q92624 585 aa7.21□□□□□ -1.26
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