RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	GLTPD2	A6NH11	291 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048		E9PSI1	815 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	WNT7A	O00755	349 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	ALDH1B1	P30837	517 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	GPSM2	P81274	684 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	SKOR1	P84550	965 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	GRAP	Q13588	217 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	MTMR2	Q13614	643 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	GCKR	Q14397	625 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	KAZALD1	Q96I82	304 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	STK31	Q9BXU1	1019 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	POLL	Q9UGP5	575 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	TNN	Q9UQP3	1299 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	CHD4	Q14839	1912 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	SHTN1	A0MZ66	631 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	YDJC	A8MPS7	323 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	FZD9	O00144	591 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	HTRA3	P83110	453 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	FOXO4	P98177	505 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	AOC3	Q16853	763 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	SP8	Q8IXZ3	490 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	CYP4X1	Q8N118	509 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	GREM2	Q9H772	168 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	CEP350	Q5VT06	3117 aa		6.46	□□□□□ -1.37
MDM2-234	ENST00000546048	CFAP99	D6REC4	459 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SNAP23	O00161	211 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SPTLC1	O15269	473 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	PDE8A	O60658	829 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	BBOX1	O75936	387 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	KLRK1	P26718	216 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	GJA5	P36382	358 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CTSW	P56202	376 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	PSMD1	Q99460	953 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.46	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SBF1	O95248	1867 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	TAF1	P21675	1872 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CSF1R	P07333	972 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	PTPRN	Q16849	979 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	MPND	Q8N594	471 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	LINS1	Q8NG48	757 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SUCLG2	Q96I99	432 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	AAAS	Q9NRG9	546 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	PPIP5K2	O43314	1243 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	BCAR3	O75815	825 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	EPS15	P42566	896 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	SCNN1D	P51172	638 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CXCL9	Q07325	125 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF787	Q6DD87	383 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DLK2	Q6UY11	383 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		6.44	□□□□□ -1.38
MDM2-234	ENST00000546048	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		6.44	□□□□□ -1.38

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