RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 GLB1P16278 677 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 Q6ZS46 218 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 SPG7Q9UQ90 795 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 GIPC1O14908 333 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 FGD1P98174 961 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 TP53INP1Q96A56 240 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 CEP41Q9BYV8 373 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 RNF208Q9H0X6 261 aa8.41□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 CYP11A1P05108 521 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ERCC3P19447 782 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 GSTT1P30711 240 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 ARTNQ5T4W7 220 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 FRMD6Q96NE9 622 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.4□□□□□ -1.06
CCDC82-208ENST00000545264 FAAP100Q0VG06 881 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 C12orf49Q9H741 205 aa8.39□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 MEGF11A6BM72 1044 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 MAOBP27338 520 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 GNA15P30679 374 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 POU4F3Q15319 338 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 FDX2Q6P4F2 183 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 AP3B2Q13367 1082 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 CORO1BQ9BR76 489 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 DYRK3O43781 588 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 DLGAP3O95886 979 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 UVSSAQ2YD98 709 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 USP17L7P0C7H9 530 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 CTSBP07858 339 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 PREPP48147 710 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 CEP44Q9C0F1 390 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-208ENST00000545264 ECEL1O95672 775 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 RNF19AQ9NV58 838 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 PARP2Q9UGN5 583 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 AK5Q9Y6K8 562 aa8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 TIAF1O95411 115 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 PDE3AQ14432 1141 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 MYRFLQ96LU7 910 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 FBXO24O75426 580 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 PSMD2Q13200 908 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 SULF2Q8IWU5 870 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 RAD18Q9NS91 495 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 NME2P22392 152 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 DAB2P98082 770 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-208ENST00000545264 RAXQ9Y2V3 346 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms