RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	AK2	P54819	239 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF213	O14771	459 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	FGA	P02671	866 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DPEP1	P16444	411 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	RPS6KB1	P23443	525 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	STYK1	Q6J9G0	422 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MPND	Q8N594	471 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MYH7	P12883	1935 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GRIN3B	O60391	1043 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MBD4	O95243	580 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CUL4A	Q13619	759 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CNKSR1	Q969H4	720 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CPA1	P15085	419 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ALX1	Q15699	326 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610		E7EWF7	191 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TGFB2	P61812	414 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	FGD1	P98174	961 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ARMT1	Q9H993	441 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	POLL	Q9UGP5	575 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DDIT3	P35638	169 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	EYA3	Q99504	573 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NAPB	Q9H115	298 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CD209	Q9NNX6	404 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DOCK2	Q92608	1830 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610		G3V3G9	751 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	IL1R1	P14778	569 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CHRNA5	P30532	468 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GSTO1	P78417	241 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NUCB2	P80303	420 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TRDN	Q13061	729 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZMYM6	O95789	1325 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-222	ENST00000534610	FOXP2	O15409	715 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	LDHC	P07864	332 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	MECOM	Q03112	1051 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NCOA7	Q8NI08	942 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	COA1	Q9GZY4	146 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SBF1	O95248	1867 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TDO2	P48775	406 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	HAND2	P61296	217 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	LCORL	Q8N3X6	602 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NBR1	Q14596	966 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610		Q6ZUG5	572 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	BCS1L	Q9Y276	419 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	PRDX5	P30044	214 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SLF2	Q8IX21	1173 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CACNA1S	Q13698	1873 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	MCM5	P33992	734 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
ATG13-222	ENST00000534610	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.17	■□□□□ 0.5

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