RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC69A6NI79 296 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 CTAGE5O15320 804 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PPFIA4O75335 1185 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 KCNJ6P48051 423 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 SLAIN2Q9P270 581 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 FIBPO43427 364 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 GPTP24298 496 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 DDR1Q08345 913 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 NEDD9Q14511 834 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 GBP6Q6ZN66 633 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TEX11Q8IYF3 940 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 RASEFQ8IZ41 740 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 STRN4Q9NRL3 753 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 MCM8Q9UJA3 840 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 VPS18Q9P253 973 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 GLI3P10071 1580 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 F13A1P00488 732 aa9.74□□□□□ -0.85
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TRPS1-209ENST00000519674 ADCY2Q08462 1091 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 NEBLO76041 1014 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 APOBRQ0VD83 1088 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 SCRN1Q12765 414 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 EVI5LQ96CN4 794 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ETAA1Q9NY74 926 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 STRCQ7RTU9 1775 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 A0A087WZG4 1122 aa9.73□□□□□ -0.85
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TRPS1-209ENST00000519674 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 NBPF26B4DH59 902 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PTH1RQ03431 593 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 NBPF14Q5TI25 921 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 NBPF15Q8N660 670 aa9.73□□□□□ -0.85
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TRPS1-209ENST00000519674 VEZTQ9HBM0 779 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC151A5D8V7 595 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 STX6O43752 255 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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TRPS1-209ENST00000519674 IL2RBP14784 551 aa9.73□□□□□ -0.85
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TRPS1-209ENST00000519674 ZNF165P49910 485 aa9.73□□□□□ -0.85
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TRPS1-209ENST00000519674 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 CRYMQ14894 314 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 FAM227BQ96M60 508 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 DNAI1Q9UI46 699 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 RTN2O75298 545 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 EXOC5O00471 708 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 FSD1Q9BTV5 496 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-209ENST00000519674 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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