RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517275.3

RNU6-840P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 840, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-840P, Length 65 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-840P-201ENST00000517275 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-840P-201ENST00000517275 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-840P-201ENST00000517275 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-840P-201ENST00000517275 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-840P-201ENST00000517275 TMX1Q9H3N1 280 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-840P-201ENST00000517275 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-840P-201ENST00000517275 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 F6X3S4 739 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 C2CD2LO14523 706 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 TRIM37O94972 964 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ATE1O95260 518 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZNF165P49910 485 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 CTBSQ01459 385 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 AP3B2Q13367 1082 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 RASIP1Q5U651 963 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 WNT8BQ93098 351 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PLD4Q96BZ4 506 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 EHMT1Q9H9B1 1298 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SNTG2Q9NY99 539 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ANKRD62A6NC57 917 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 J3QW42 95 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PPFIA3O75145 1194 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ARNTP27540 789 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ADH6P28332 368 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ADH7P40394 386 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 CASP7P55210 303 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PERM1Q5SV97 790 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 CEP135Q66GS9 1140 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SULF2Q8IWU5 870 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 DACH1Q9UI36 760 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 H3BRJ5 948 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 BMP4P12644 408 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 MAP2K3P46734 347 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 EIF6P56537 245 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SEZ6Q53EL9 994 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 FAM35AQ86V20 835 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 KRT82Q9NSB4 513 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 KLF15Q9UIH9 416 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PPT2Q9UMR5 302 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 VSIG8P0DPA2 414 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 LMNB1P20700 586 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 RASGRF1Q13972 1273 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SEPT6Q14141 434 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 GAS6Q14393 721 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 DDR2Q16832 855 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SV2AQ7L0J3 742 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 JMYQ8N9B5 988 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 ELOA3Q8NG57 546 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 FBXO27Q8NI29 283 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 STK35Q8TDR2 534 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 BPNT1O95861 308 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 CPB1P15086 417 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 SELPP16109 830 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 MX2P20592 715 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 EPHA1P21709 976 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 PIP4K2BP78356 416 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 TCEAL1Q15170 157 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-840P-201ENST00000517275 GRIK5Q16478 980 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms