RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF576Q9H609 170 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRAK1Q9UPV9 953 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HMX2A2RU54 273 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TIAF1O95411 115 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DLGAP3O95886 979 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RXRBP28702 533 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 USP11P51784 963 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNA1Q09470 495 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 POU4F3Q15319 338 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DBNDD2Q9BQY9 259 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CORO1BQ9BR76 489 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ABCB6Q9NP58 842 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP4R2Q9NY27 417 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TREHO43280 583 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAOBP27338 520 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GRIK1P39086 918 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PLCB3Q01970 1234 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AP3B2Q13367 1082 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GRM2Q14416 872 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SGO2Q562F6 1265 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GIMAP7Q8NHV1 300 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RAD18Q9NS91 495 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PCMTD2Q9NV79 361 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COBLO75128 1261 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TGFB1P01137 390 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ADH5P11766 374 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DRD2P14416 443 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SSTR4P31391 388 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CD97P48960 835 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PDE3AQ14432 1141 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DSC3Q14574 896 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PAOXQ6QHF9 649 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DTHD1Q6ZMT9 781 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CTSBP07858 339 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FCGRTP55899 365 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP2R3AQ06190 1150 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NFKBIBQ15653 356 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FBLIM1Q8WUP2 373 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRAIPQ9BWF2 469 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BCO2Q9BYV7 579 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ATG3Q9NT62 314 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRR19A6NJB7 356 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WDR64B1ANS9 1081 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AOC2O75106 756 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ECEL1O95672 775 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAPK8P45983 427 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ATP2B2Q01814 1243 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAAP100Q0VG06 881 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP7Q14244 749 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PI16Q6UXB8 463 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DYMQ7RTS9 669 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FBXL6Q8N531 539 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FBF1Q8TES7 1133 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MFSD14AQ96MC6 490 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ASB16Q96NS5 453 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM39AQ9NV64 488 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ACTL7BQ9Y614 415 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MED26O95402 600 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLFN14P0C7P3 912 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RAB6AP20340 208 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GSTT1P30711 240 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ASPAP45381 313 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms