RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 PHF14O94880 888 aa26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 MBD4O95243 580 aa26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 ELP1O95163 1332 aa26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 RESTQ13127 1097 aa26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 TRDNQ13061 729 aa26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 RBSNQ9H1K0 784 aa26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 H3BQV1 296 aa26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 IFFO2Q5TF58 517 aa26.9■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 ARMT1Q9H993 441 aa26.89■■□□□ 1.9
PDE4D-223ENST00000515011 GNAT2P19087 354 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 GYG1P46976 350 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 TTC6Q86TZ1 520 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.87■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.87■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.87■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 NAPBQ9H115 298 aa26.87■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.87■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.86■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 RFC4P35249 363 aa26.86■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 LCORLQ8N3X6 602 aa26.86■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.85■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CHD4Q14839 1912 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 NEDD4P46934 1319 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 KLHL34Q8N239 644 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 TSPY26PQ9H489 355 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 SEMA3EO15041 775 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 ADRA2BP18089 450 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 TM4SF1P30408 202 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CACNA1SQ13698 1873 aa26.83■■□□□ 1.89
PDE4D-223ENST00000515011 CYP7A1P22680 504 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM87BQ96K49 555 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 B4E1Z4 1266 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 VPS37DQ86XT2 251 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 SPATA32Q96LK8 384 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 PRKAB2O43741 272 aa26.81■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 ABCF2Q9UG63 623 aa26.81■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.81■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 RAI14Q9P0K7 980 aa26.81■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 NFIXQ14938 502 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 TDO2P48775 406 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.79■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.79■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 KLRK1P26718 216 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB22O15209 634 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.78■■□□□ 1.88
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