RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513418.1

SMAD5-208, Transcript of SMAD family member 5, human

TSL 5

Gene SMAD5, Length 523 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD5-208	ENST00000513418	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418		H3BRJ5	948 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ZNF862	O60290	1169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TCF3	P15923	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PTPRA	P18433	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GSTT1	P30711	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	SEPT6	Q14141	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PCSK7	Q16549	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	RHOV	Q96L33	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418		E9PSI1	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	IGHA1	P01876	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	MAOB	P27338	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ZNF76	P36508	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	LIG3	P49916	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GSTM4	Q03013	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	IKBKE	Q14164	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PF4	P02776	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PROC	P04070	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	CHRNA4	P43681	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	INPP5A	Q14642	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GNB5	O14775	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	DNAJA2	O60884	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	F13A1	P00488	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	DRD2	P14416	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	LIG1	P18858	919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	NTF4	P34130	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	FGD1	P98174	961 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	FAM221A	A4D161	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GIPC1	O14908	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	IGSF3	O75054	1194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMAD5-208	ENST00000513418	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	NOS3	P29474	1203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	RNF34	Q969K3	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMAD5-208	ENST00000513418	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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