RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 JDP2Q8WYK2 163 aa10.05□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.05□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.05□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 TONSLQ96HA7 1378 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC35F4A4IF30 521 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADH1AP07327 375 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC93Q567U6 631 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBPF15Q8N660 670 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 SETDB2Q96T68 719 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 SCN4AP35499 1836 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 ESPNB1AK53 854 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAF5O00463 557 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTGIRP43119 386 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 STYK1Q6J9G0 422 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 CNBD1Q8NA66 436 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 GCC1Q96CN9 775 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 MASTLQ96GX5 879 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.03□□□□□ -0.8
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDC14CA4D256 554 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 LILRA1O75019 489 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 STARD3NLO95772 234 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 ITGA6P23229 1130 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRT76Q01546 638 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 GPC2Q8N158 579 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF217Q8TC41 542 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL15A1P39059 1388 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZBBXA8MT70 800 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC39A6Q13433 755 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDCA8Q53HL2 280 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 CST9Q5W186 159 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SV2AQ7L0J3 742 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYNE4Q8N205 404 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 CYLDQ9NQC7 956 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.01□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SRGNP10124 158 aa10□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 TESK2Q96S53 571 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 POLKQ9UBT6 870 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.99□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 NPR1P16066 1061 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 EPS15P42566 896 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLX4Q8IY92 1834 aa9.98□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM177BA6PVY3 158 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 FZD9O00144 591 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 ALDH1B1P30837 517 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 NOGQ13253 232 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 OLFM4Q6UX06 510 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.97□□□□□ -0.81
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRPA1O75762 1119 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 FBXO45P0C2W1 286 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 LGR6Q9HBX8 967 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.96□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.95□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 HUNKP57058 714 aa9.95□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms