RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF3Q9H094 633 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.82e-6■■■□□ 16.5
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UBE2B-207ENST00000510021 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 CERS5Q8N5B7 392 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 CACNA1AO00555 2505 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 IRF6O14896 467 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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UBE2B-207ENST00000510021 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 ERO1BQ86YB8 467 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 TEPSINQ96N21 525 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 FLT3LGP49771 235 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 NUDCQ9Y266 331 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 SPEF2Q9C093 1822 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 BCRP11274 1271 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 FOSL2P15408 326 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 PPIL2Q13356 520 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 TNFAIP1Q13829 316 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 PDHXO00330 501 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 KLRK1P26718 216 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 IRF5Q13568 498 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 CFAP53Q96M91 514 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-207ENST00000510021 F8W031 263 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 USP38Q8NB14 1042 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 SPDYE2Q495Y8 402 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 PFASO15067 1338 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 PDE8AO60658 829 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 LEMD3Q9Y2U8 911 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 MUC6Q6W4X9 2439 aa19.99■□□□□ 0.79
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UBE2B-207ENST00000510021 TMEM39BQ9GZU3 492 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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UBE2B-207ENST00000510021 CD209Q9NNX6 404 aa19.96■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.96■□□□□ 0.79
UBE2B-207ENST00000510021 WRNIP1Q96S55 665 aa19.95■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.95■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa19.95■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 PPATQ06203 517 aa19.94■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
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UBE2B-207ENST00000510021 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.93■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 TCP10L2B9ZVM9 353 aa19.93■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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UBE2B-207ENST00000510021 CYP2C8P10632 490 aa19.93■□□□□ 0.78
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UBE2B-207ENST00000510021 KCNH4Q9UQ05 1017 aa19.93■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 COL6A1P12109 1028 aa19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 NFE2L2Q16236 605 aa19.91■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 HMGCRP04035 888 aa19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 TNNI2P48788 182 aa19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 ASB2Q96Q27 587 aa19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 LTBP2Q14767 1821 aa19.9■□□□□ 0.78
UBE2B-207ENST00000510021 MYH3P11055 1940 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 CTSWP56202 376 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 MAST2Q6P0Q8 1798 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 SHHQ15465 462 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 GREM2Q9H772 168 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 NEFMP07197 916 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-207ENST00000510021 TRIM32Q13049 653 aa19.87■□□□□ 0.77
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