RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATP9B	O43861	1147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAD21	O60216	631 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRPA1	O75762	1119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	AOC3	Q16853	763 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ARRDC3-204	ENST00000507075	FOXO3	O43524	673 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075		A6NJR5	290 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	GLI1	P08151	1106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	SYN1	P17600	705 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	COX20	Q5RI15	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	WEE1	P30291	646 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	IKBKE	Q14164	716 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	NUAK1	O60285	661 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	DPYD	Q12882	1025 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	CTSB	P07858	339 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	FLII	Q13045	1269 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEACAM5	P06731	702 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	BMP7	P18075	431 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	AFM	P43652	599 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	LINC00310	P59036	64 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	NFIX	Q14938	502 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ARRDC3-204	ENST00000507075	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	OXCT1	P55809	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	SUV39H1	O43463	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	ASPA	P45381	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	GSTM4	Q03013	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZP2	Q05996	745 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	PTK7	Q13308	1070 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	GLDC	P23378	1020 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADRB1	P08588	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	IKZF1	Q13422	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARRDC3-204	ENST00000507075	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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