RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.58	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	MAOB	P27338	520 aa		7.58	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	IRAK1	P51617	712 aa		7.58	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	ORC1	Q13415	861 aa		7.58	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.58	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	USP11	P51784	963 aa		7.57	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.57	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268		H3BRB1	525 aa		7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	WNT11	O96014	354 aa		7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	GATA6	Q92908	595 aa		7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.56	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	ADH5	P11766	374 aa		7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	POU4F3	Q15319	338 aa		7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		7.55	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	IGHA2	P01877	340 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	PAOX	Q6QHF9	649 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.54	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	NFIC	P08651	508 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	FOSL1	P15407	271 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-222	ENST00000498268	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	GPR182	O15218	404 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	PAX4	O43316	350 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	B3GALT4	O96024	378 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	CYP11A1	P05108	521 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ITPKA	P23677	461 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	DYM	Q7RTS9	669 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ABI1	Q8IZP0	508 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	EHD4	Q9H223	541 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	RAB6A	P20340	208 aa		7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	LGR6	Q9HBX8	967 aa		7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.5	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	CYP26A1	O43174	497 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	AOC2	O75106	756 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	NDUFB5	O43674	189 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ASPA	P45381	313 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	LIG1	P18858	919 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ARID3A	Q99856	593 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	RNF114	Q9Y508	228 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-222	ENST00000498268	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	PRNP	P04156	253 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	NEFL	P07196	543 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	PDE3B	Q13370	1112 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
USP34-222	ENST00000498268	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22

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