RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 AIDAQ96BJ3 306 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 NEK1Q96PY6 1258 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 DTNBO60941 627 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 UFL1O94874 794 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 LARGE1O95461 756 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 ARMT1Q9H993 441 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 DOCK2Q92608 1830 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MBD4O95243 580 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 RPS6KB1P23443 525 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CYP7A1P22680 504 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF445P59923 1031 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 KRT32Q14532 448 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 POLLQ9UGP5 575 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 GGA1Q9UJY5 639 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 E7EWF7 191 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PDE6BP35913 854 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CUL4AQ13619 759 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PKP1Q13835 747 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PRKAB2O43741 272 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LCORLQ8N3X6 602 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 C6orf229H3BNL8 230 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NPR1P16066 1061 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF384Q8TF68 577 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PRDX5P30044 214 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CHST3Q7LGC8 479 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 SEMA3EO15041 775 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ATP2B4P23634 1241 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TPM2P07951 284 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CHRNA5P30532 468 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ME3Q16798 604 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 Q6ZUG5 572 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 SP8Q8IXZ3 490 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NECAB1Q8N987 351 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF213O14771 459 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 RIMBP2O15034 1052 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MASTLQ96GX5 879 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MECOMQ03112 1051 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LAMA4Q16363 1823 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ALDH1B1P30837 517 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 STK3Q13188 491 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NBPF3Q9H094 633 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 CD209Q9NNX6 404 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 GRIK5Q16478 980 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 INCENPQ9NQS7 918 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 CACNA1SQ13698 1873 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 H0YIN7 160 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 FGD1P98174 961 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ST3GAL1Q11201 340 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NAPBQ9H115 298 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 RBSNQ9H1K0 784 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 MPNDQ8N594 471 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.42■□□□□ 0.86
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