RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 SYNJ2O15056 1496 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 PRR19A6NJB7 356 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 FZD6O60353 706 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 TRPA1O75762 1119 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 BMP3P12645 472 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 SERPINB4P48594 390 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 IRAK1P51617 712 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 C8orf34Q49A92 452 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 FDX2Q6P4F2 183 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 BEND4Q6ZU67 534 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.9□□□□□ -1.46
RARB-208ENST00000489694 ARAP1Q96P48 1450 aa5.9□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.9□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 PAX4O43316 350 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ADAMTS4O75173 837 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 FAM13AO94988 1023 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 DTX1Q86Y01 620 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TTC16Q8NEE8 873 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 PMEPA1Q969W9 287 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SAMD9Q5K651 1589 aa5.89□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 MEGF11A6BM72 1044 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 H3BRB1 525 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ICMTO60725 284 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ARL4DP49703 201 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ECM1Q16610 540 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 HGSNATQ68CP4 663 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 BSNDQ8WZ55 320 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 OSMRQ99650 979 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 GRIN2AQ12879 1464 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 IQGAP2Q13576 1575 aa5.88□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 EREGO14944 169 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 PHACTR2O75167 634 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TNFRSF21O75509 655 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 EDN3P14138 238 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 IKBKEQ14164 716 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 GJD3Q8N144 294 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 NXPE3Q969Y0 559 aa5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 NUP160Q12769 1436 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TIAF1O95411 115 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 AAMPQ13685 434 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SGO2Q562F6 1265 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 FMNL2Q96PY5 1086 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 USP26Q9BXU7 913 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 WDR64B1ANS9 1081 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ARHGAP4P98171 946 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 EHHADHQ08426 723 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.85□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 WNT11O96014 354 aa5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 USP5P45974 858 aa5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 CYP4F12Q9HCS2 524 aa5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 PIM2Q9P1W9 311 aa5.84□□□□□ -1.47
RARB-208ENST00000489694 TIAM1Q13009 1591 aa5.84□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 BTBD11A6QL63 1104 aa5.83□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 DLGAP3O95886 979 aa5.83□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 TXKP42681 527 aa5.83□□□□□ -1.48
RARB-208ENST00000489694 PDE4CQ08493 712 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms