RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485499.1

PTPRT-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRT, Length 208 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-208ENST00000485499 XAGE2Q96GT9 111 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 RGS19P49795 217 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 GTF2IP78347 998 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 PIM2Q9P1W9 311 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 GLTPD2A6NH11 291 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 IL2RAP01589 272 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 KCNA3P22001 575 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 INHAP05111 366 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SCNN1DP51172 638 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 GDF10P55107 478 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 IP6K1Q92551 441 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SLURP2P0DP57 97 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 CHRNA5P30532 468 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SIK1P57059 783 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 TMF1P82094 1093 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 CENPCQ03188 943 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 WDR44Q5JSH3 913 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 BACH1O14867 736 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 LMNB1P20700 586 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 ITPK1Q13572 414 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SVOPQ8N4V2 548 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 SLX4Q8IY92 1834 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-208ENST00000485499 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 HOXC9P31274 260 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 PTSQ03393 145 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 OGFOD1Q8N543 542 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 GYS1P13807 737 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 TLR1Q15399 786 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 PIGBQ92521 554 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 RTL1A6NKG5 1358 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 KDRP35968 1356 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 BCORQ6W2J9 1755 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 MSTNO14793 375 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 RFC4P35249 363 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 AMPHP49418 695 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 CLDN10P78369 228 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 SIX5Q8N196 739 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 WHAMMQ8TF30 809 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 NBPF4Q96M43 638 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 PASKQ96RG2 1323 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 A0A1W2PP64 1363 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 SLC35F4A4IF30 521 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 FAM196BA6NMK8 535 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 M0R2N6 131 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 CYP27B1O15528 508 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRT-208ENST00000485499 RASA1P20936 1047 aa8.43□□□□□ -1.06
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