RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 TNFAIP1Q13829 316 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 CDCA5Q96FF9 252 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 AAMPQ13685 434 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 RASGRF1Q13972 1273 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 NF2P35240 595 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 ECE1P42892 770 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 SLF2Q8IX21 1173 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 GRIK5Q16478 980 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 SPATA5Q8NB90 893 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 PRDX5P30044 214 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 TNNI2P48788 182 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-203ENST00000474160 MCAMP43121 646 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 VEGFBP49765 207 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 HUNKP57058 714 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 VEZTQ9HBM0 779 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 CLRN2A0PK11 232 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 FAM83AQ86UY5 434 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 AACSQ86V21 672 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 ABCF2Q9UG63 623 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 GAKO14976 1311 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 UNCXA6NJT0 531 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 GSTO1P78417 241 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 CAPNS2Q96L46 248 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 LDHCP07864 332 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 MAP2K2P36507 400 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 RASA3Q14644 834 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 DLK2Q6UY11 383 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 CCDC102AQ96A19 550 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 RGMBQ6NW40 437 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 HOOK2Q96ED9 719 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 DCTPP1Q9H773 170 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 AOX1Q06278 1338 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K11Q16584 847 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 CRBNQ96SW2 442 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-203ENST00000474160 NOGQ13253 232 aa23.14■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.14■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.14■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 MECOMQ03112 1051 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 PI16Q6UXB8 463 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 380.4 ms