RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 CCP110O43303 1012 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PDE4BQ07343 736 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 HAUS7Q99871 368 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 UTYO14607 1347 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 FOXN1O15353 648 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 TUBB4AP04350 444 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 GCKRQ14397 625 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PDIA6Q15084 440 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.56■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 MYL5Q02045 173 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ANO1Q5XXA6 986 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 VPS18Q9P253 973 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN12O43309 604 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SYKP43405 635 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 TIMM10P62072 90 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 IKBKBO14920 756 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SPECC1Q5M775 1068 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 KIFC2Q96AC6 838 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.55■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 NCAPD2Q15021 1401 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 TPM1P09493 284 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.54■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ATP8B1O43520 1251 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 YEATS4O95619 227 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 COPS6Q7L5N1 327 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ARHGAP6O43182 974 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 CMA1P23946 247 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.53■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 BMP6P22004 513 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SHC4Q6S5L8 630 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 RXRAP19793 462 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 AK7Q96M32 723 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ATG3Q9NT62 314 aa20.52■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SRLQ86TD4 932 aa20.52■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 COPRSQ9NQ92 184 aa20.52■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 M0R2C6 588 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 CBFA2T2O43439 604 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PHACTR2O75167 634 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 ZNF827Q17R98 1081 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 LONRF3Q496Y0 759 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 TC2NQ8N9U0 490 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 GOLGA1Q92805 767 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PALLDQ8WX93 1383 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 RABGGTAQ92696 567 aa20.51■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PXDNQ92626 1479 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 MAST3O60307 1309 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 TXLNAP40222 546 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PNKPQ96T60 521 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 DIP2BQ9P265 1576 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 IP6K1Q92551 441 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 EXOC4Q96A65 974 aa20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PREB-208ENST00000468045 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.49■□□□□ 0.87
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