RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	LARGE1	O95461	756 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	FGA	P02671	866 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	APP	P05067	770 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH1B1	P30837	517 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	HAND2	P61296	217 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD1	Q15327	319 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	LCORL	Q8N3X6	602 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		14.62	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	GNAT2	P19087	354 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		14.61	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	C6orf229	H3BNL8	230 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF213	O14771	459 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	STYK1	Q6J9G0	422 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	14.6	□□□□□ -0.07	3e-11	■■□□□ 12.6
HDLBP-231	ENST00000467435	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	POLL	Q9UGP5	575 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	JAG2	Q9Y219	1238 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		14.6	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435		H0YIN7	160 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	PRDX5	P30044	214 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	NUCB2	P80303	420 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	MECOM	Q03112	1051 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ALX1	Q15699	326 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6ZUG5	572 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	NAPB	Q9H115	298 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	CD209	Q9NNX6	404 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
HDLBP-231	ENST00000467435	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	IGSF3	O75054	1194 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	IL1R1	P14778	569 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	FGD1	P98174	961 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	ME3	Q16798	604 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC125	Q86Z20	511 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF384	Q8TF68	577 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		14.58	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKAB2	O43741	272 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	TDO2	P48775	406 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	ST3GAL1	Q11201	340 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	OLFM4	Q6UX06	510 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	MPND	Q8N594	471 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	NCOA7	Q8NI08	942 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	NBPF3	Q9H094	633 aa		14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNA5	P30532	468 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	CNKSR1	Q969H4	720 aa		14.56	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	RIMBP2	O15034	1052 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	MCM5	P33992	734 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	TRDN	Q13061	729 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	PKP1	Q13835	747 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	NECAB1	Q8N987	351 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	BRF1	Q92994	677 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	GBP4	Q96PP9	640 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	COA1	Q9GZY4	146 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		14.55	□□□□□ -0.08
HDLBP-231	ENST00000467435	NEDD4	P46934	1319 aa		14.55	□□□□□ -0.08

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