RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	VEZT	Q9HBM0	779 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	MTX1	Q13505	466 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF333	Q96JL9	665 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	MS4A1	P11836	297 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CHRND	Q07001	517 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	GTF2A2	P52657	109 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CD209	Q9NNX6	404 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD1	Q9UP38	647 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CSAD	Q9Y600	493 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	BRCA2	P51587	3418 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	OTOF	Q9HC10	1997 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CLRN2	A0PK11	232 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245		F8W031	263 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB22	O15209	634 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	GNRH1	P01148	92 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	SPDYE6	P0CI01	402 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	PRMT2	P55345	433 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CFAP100	Q494V2	611 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	OPTN	Q96CV9	577 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	MEIS3	Q99687	375 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	ELP3	Q9H9T3	547 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CIAO1	O76071	339 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	TNNI2	P48788	182 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	RASA3	Q14644	834 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CCL15	Q16663	113 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-223	ENST00000466245		H0YGN5	161 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	IL1R1	P14778	569 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	DPF3	Q92784	378 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	COPRS	Q9NQ92	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	EYA2	O00167	538 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE8B	O95263	885 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	GNAI2	P04899	355 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	KLRK1	P26718	216 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	HOOK2	Q96ED9	719 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF5L	O75529	589 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	CETP	P11597	493 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXD10	P28358	340 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	GJA5	P36382	358 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPN18	Q99952	460 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TNN	Q9UQP3	1299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SNAP23	O00161	211 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	FGFR2	P21802	821 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP3K9	P80192	1104 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	CERS5	Q8N5B7	392 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	OTUD5	Q96G74	571 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-223	ENST00000466245	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		12.49	□□□□□ -0.41

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