RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 EYA3Q99504 573 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 BCS1LQ9Y276 419 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 GPAA1O43292 621 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 RASEFQ8IZ41 740 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 FBXW7Q969H0 707 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 CYP7A1P22680 504 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 TICAM2Q86XR7 235 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 G3V3G9 751 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 HSPA4P34932 840 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 ARMT1Q9H993 441 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 NECTIN1Q15223 517 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPN3-209ENST00000466222 PPIP5K2O43314 1243 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 MBD4O95243 580 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB22O15209 634 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 ECE2O60344 883 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 LCORLQ8N3X6 602 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CERS5Q8N5B7 392 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 AIDAQ96BJ3 306 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 PRKAB2O43741 272 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 MRE11P49959 708 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CACNA1SQ13698 1873 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 PSMD1Q99460 953 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 YDJCA8MPS7 323 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 PODNQ7Z5L7 613 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 AK9Q5TCS8 1911 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 F8W031 263 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 SLC27A2O14975 620 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 MCCP23508 829 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 NFKBIEO00221 500 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 FGAP02671 866 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 APPP05067 770 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CYP21A2P08686 494 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 CPA1P15085 419 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPN3-209ENST00000466222 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 SOGA3Q5TF21 947 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 SYT17Q9BSW7 474 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 COL4A5P29400 1685 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 PRELPP51888 382 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 RASSF7Q02833 373 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 HAND2P61296 217 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 NUCB2P80303 420 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 DACT2Q5SW24 774 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 KCNB2Q92953 911 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 ST18O60284 1047 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 RAD17O75943 681 aa22.12■■□□□ 1.13
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