RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.66□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.66□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 AAASQ9NRG9 546 aa8.66□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 GINM1Q9NU53 330 aa8.66□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.66□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A096LPE4 126 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1W2PPZ6 126 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 LCE2BO14633 110 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 ENC1O14682 589 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 PF4P02776 101 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 SIK1P57059 783 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 GPLD1P80108 840 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 GMCL1Q96IK5 515 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF576Q9H609 170 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 DACH1Q9UI36 760 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRPF4B-204ENST00000466185 KIF14Q15058 1648 aa8.65□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 J3QW42 95 aa8.64□□□□□ -1.03
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PRPF4B-204ENST00000466185 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 LMNB2Q03252 620 aa8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 FAAP100Q0VG06 881 aa8.64□□□□□ -1.03
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PRPF4B-204ENST00000466185 FAM182BQ5T319 152 aa8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 PBX4Q9BYU1 374 aa8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TLDC2A0PJX2 215 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 PAGE1O75459 146 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ITGA6P23229 1130 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 SOX9P48436 509 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ATP11AP98196 1134 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 NEUROD1Q13562 356 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRPF4B-204ENST00000466185 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRPF4B-204ENST00000466185 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 UBP1Q9NZI7 540 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.62□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.62□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.62□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 PHF24Q9UPV7 400 aa8.62□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 CTBSQ01459 385 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 MUC3BQ9H195 1237 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 NCOA2Q15596 1464 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 CD109Q6YHK3 1445 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ETFBP38117 255 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 CRKP46108 304 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 APOBRQ0VD83 1088 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 NBPF4Q96M43 638 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 IGFLR1Q9H665 355 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TBX22Q9Y458 520 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 GHRHP01286 108 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 SERINC3Q13530 473 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 SYT9Q86SS6 491 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 PLCH2O75038 1416 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF4B-204ENST00000466185 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRPF4B-204ENST00000466185 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF4B-204ENST00000466185 PCSK7Q16549 785 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF4B-204ENST00000466185 RASIP1Q5U651 963 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF4B-204ENST00000466185 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF4B-204ENST00000466185 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF4B-204ENST00000466185 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.58□□□□□ -1.04
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