RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 CHADLQ6NUI6 762 aa13.49□□□□□ -0.25
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RPRD1B-202ENST00000449186 SMC5Q8IY18 1101 aa13.49□□□□□ -0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR66Q8TBY9 1149 aa13.49□□□□□ -0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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RPRD1B-202ENST00000449186 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.259e-8■■□□□ 11.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 USP48Q86UV5 1035 aa13.48□□□□□ -0.25
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RPRD1B-202ENST00000449186 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.47□□□□□ -0.25
RPRD1B-202ENST00000449186 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.47□□□□□ -0.25
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RPRD1B-202ENST00000449186 TCP10L2B9ZVM9 353 aa13.42□□□□□ -0.26
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RPRD1B-202ENST00000449186 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.42□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 CST9Q5W186 159 aa13.42□□□□□ -0.26
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RPRD1B-202ENST00000449186 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 NFIAQ12857 509 aa13.41□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.41□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.41□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RPRD1B-202ENST00000449186 MAGEB6Q8N7X4 407 aa13.41□□□□□ -0.26
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RPRD1B-202ENST00000449186 PAG1Q9NWQ8 432 aa13.41□□□□□ -0.26
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