RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 TNNI2P48788 182 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 KIF16BQ96L93 1317 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 IFNL1Q8IU54 200 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 SOX10P56693 466 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TEKT1Q969V4 418 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 MAST3O60307 1309 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 BCAMP50895 628 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 EYA2O00167 538 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 SLC5A1P13866 664 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 FGFR2P21802 821 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 GRIK5Q16478 980 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 LPIN2Q92539 896 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TEPSINQ96N21 525 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 MRIQ9BWK5 157 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 OPTNQ96CV9 577 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 ELP3Q9H9T3 547 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 GJA5P36382 358 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 HOOK2Q96ED9 719 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 FBXO3Q9UK99 471 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 CSADQ9Y600 493 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-205ENST00000432588 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 LAMB1P07942 1786 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 CIAO1O76071 339 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 MAP3K9P80192 1104 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 FAM83AQ86UY5 434 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 CACNB3P54284 484 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 CRHR2Q13324 411 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 VGLL4Q14135 290 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 ERO1AQ96HE7 468 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 SIL1Q9H173 461 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 TRIM17Q9Y577 477 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 CCER2I3L3R5 266 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 GTF2A2P52657 109 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 OTOFQ9HC10 1997 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 ATP2B3Q16720 1220 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 PTPN18Q99952 460 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 DCAF15Q66K64 600 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 OTUD5Q96G74 571 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 WRNIP1Q96S55 665 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-205ENST00000432588 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CCL15Q16663 113 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 SEMA3EO15041 775 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 SP3Q02447 781 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ERO1BQ86YB8 467 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ARHGEF6Q15052 776 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 FAM151AQ8WW52 585 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 MEIS3Q99687 375 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 EFCC1Q9HA90 598 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-205ENST00000432588 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.12■□□□□ 0.81
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