RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP48Q86UV5 1035 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRBNQ96SW2 442 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF408Q9H9D4 720 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.63□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM88BA6NKF7 163 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 APBB1O00213 710 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HMMRO75330 724 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RASGRF1Q13972 1273 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DLGAP5Q15398 846 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SULF1Q8IWU6 871 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AKAP11Q9UKA4 1901 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa12.62□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SEMA3EO15041 775 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CELF2O95319 508 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GORABQ5T7V8 394 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PI16Q6UXB8 463 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DBNDD2Q9BQY9 259 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPR108Q9NPR9 543 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DENND2AQ9ULE3 1009 aa12.61□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYH2Q9UKX2 1941 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLRN2A0PK11 232 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRDX5P30044 214 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRKP46108 304 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MMP14P50281 582 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CST9Q5W186 159 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MTMR14Q8NCE2 650 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDCA5Q96FF9 252 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa12.6□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AACSQ86V21 672 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCL11AQ9H165 835 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VEZTQ9HBM0 779 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAST3O60307 1309 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SALL1Q9NSC2 1324 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.59□□□□□ -0.39
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CNTNAP1P78357 1384 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DOCK2Q92608 1830 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MCAMP43121 646 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TEKT1Q969V4 418 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLRG1Q96E93 195 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HMG20BQ9P0W2 317 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa12.58□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SSC5DA1L4H1 1573 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYO1BO43795 1136 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA5Q8NB90 893 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCF2Q9UG63 623 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.57□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OTOFQ9HC10 1997 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RASSF10A6NK89 507 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CACNB3P54284 484 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC158Q5M9N0 1113 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZDHHC15Q96MV8 337 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SNRKQ9NRH2 765 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.56□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RAB11FIP3O75154 756 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TCP10L2B9ZVM9 353 aa12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GRM1Q13255 1194 aa12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms