RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PPLO60437 1756 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 M0R2N6 131 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 KCNQ2O43526 872 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 RASA1P20936 1047 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 CLDN10P78369 228 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC27Q2M243 656 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 CEP63Q96MT8 703 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 BRD7Q9NPI1 651 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 DISP2A7MBM2 1401 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 RREB1Q92766 1687 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGEF10O15013 1369 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ITGB7P26010 798 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 KCNQ4P56696 695 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 C1QTNF8P60827 252 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP35Q9P2H5 1018 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SFI1A8K8P3 1242 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ALBP02768 609 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ADH7P40394 386 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PDE3BQ13370 1112 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 OGFOD1Q8N543 542 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 STK32AQ8WU08 396 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L15C9J2P7 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L10C9JJH3 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L12C9JPN9 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L11C9JVI0 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L21D6R901 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L18D6R9N7 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L22D6RA61 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L19D6RCP7 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L20D6RJB6 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ERCC3P19447 782 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 TYRO3Q06418 890 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 USP17L24Q0WX57 530 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SIX5Q8N196 739 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SUSD3Q96L08 255 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 NACC1Q96RE7 527 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 SBNO1A3KN83 1393 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 ROCK1Q13464 1354 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRK-210ENST00000415055 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 E9PSI1 815 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 FAM229AH3BQW9 127 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 PTK7Q13308 1070 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 MYOM1P52179 1685 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 FAM196BA6NMK8 535 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB7AO95365 584 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 NID1P14543 1247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 EVA1CP58658 441 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 CHRNA2Q15822 529 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 HIF1AQ16665 826 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 RGL3Q3MIN7 710 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-210ENST00000415055 BHMTQ93088 406 aa6.7□□□□□ -1.34
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