RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407637.5

HERC3-203, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 2,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-203ENST00000407637 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 AGLP35573 1532 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 Q6ZUG5 572 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 MCM8Q9UJA3 840 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ADALQ6DHV7 355 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 EVI5LQ96CN4 794 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NUTM2FA1L443 756 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NEBLO76041 1014 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 PAX7P23759 505 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 BIRC2Q13490 618 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 A0A1W2PQ27 194 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 A0A1W2PQ64 194 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 A0A1W2PQD8 194 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 H0YHG0 523 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 FOXO3O43524 673 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 IRAK1P51617 712 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SAMM50Q9Y512 469 aa14.62□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 IRF6O14896 467 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ZNF202O95125 648 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CCDC175P0C221 793 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTAGE8P0CG41 777 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CACNA1FO60840 1977 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 KIF5CO60282 957 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTDNEP1O95476 244 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ATP2B2Q01814 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 STK38Q15208 465 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 ATL3Q6DD88 541 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.61□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NF2P35240 595 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 VEZTQ9HBM0 779 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CLIC4Q9Y696 253 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 PIK3C2BO00750 1634 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 MED23Q9ULK4 1368 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SHTN1A0MZ66 631 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 GGCXP38435 758 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 FNTAP49354 379 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 DDR1Q08345 913 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 GPATCH3Q96I76 525 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 GRIN2DO15399 1336 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CTAGE9A4FU28 777 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 PFKFB2O60825 505 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SLC35F6Q8N357 371 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 JMYQ8N9B5 988 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NEK1Q96PY6 1258 aa14.59□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PFKFB1P16118 471 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 WDR93Q6P2C0 686 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 455.6 ms