RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384199.1

RNU6-1024P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1024, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1024P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LMNAP02545 664 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FGFR3P22607 806 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CTBSQ01459 385 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC23A3Q6PIS1 610 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF503Q96F45 646 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MISP3Q96FF7 219 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DCTN5Q9BTE1 182 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TTPALQ9BTX7 342 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DRGXA6NNA5 263 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZAR1LA6NP61 321 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ALBP02768 609 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 F13BP05160 661 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DNAH10OSP0CZ25 163 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CD8BP10966 210 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ABCG1P45844 678 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC1A5Q15758 541 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 STRIP1Q5VSL9 837 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SCARA3Q6AZY7 606 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ABHD15Q6UXT9 468 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 Q6ZS46 218 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 Q6ZS52 159 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C18orf65Q6ZTR6 163 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM214BQ7L5A3 538 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRR12Q9ULL5 1215 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CTNND2Q9UQB3 1225 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DYRK1BQ9Y463 629 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 COX11Q9Y6N1 276 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TTC28Q96AY4 2481 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TNXBP22105 4242 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MUSKO15146 869 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PYGBP11216 843 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HTRA3P83110 453 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PTH1RQ03431 593 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FOXF2Q12947 444 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BNIP3Q12983 259 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UVSSAQ2YD98 709 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KMT5BQ4FZB7 885 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NT5DC1Q5TFE4 455 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ANKRD34AQ69YU3 496 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM130Q8N3G9 435 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FBXL6Q8N531 539 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM212AQ96EL1 285 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SEMA4AQ9H3S1 761 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 IGFLR1Q9H665 355 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 IRAK3Q9Y616 596 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 F8W735 103 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FOXN1O15353 648 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FOXH1O75593 365 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PLATP00750 562 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 VARSP26640 1264 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LTBRP36941 435 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FBXO11Q86XK2 927 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DNASE2BQ8WZ79 361 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SIGLEC10Q96LC7 697 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FCRL4Q96PJ5 515 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MCOLN1Q9GZU1 580 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DEF6Q9H4E7 631 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DUSP10Q9Y6W6 482 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NAV2Q8IVL1 2488 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 USH2AO75445 5202 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 STAB1Q9NY15 2570 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LINC01565O15544 149 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LILRB5O75023 590 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CSF2RBP32927 897 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM132EQ6IEE7 984 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BEND4Q6ZU67 534 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF627Q7L945 461 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SHISA5Q8N114 240 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DTWD1Q8N5C7 304 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KREMEN1Q96MU8 473 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CTAGE1Q96RT6 745 aa-1.28□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms