RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376085.3

LRRC38-201, Transcript of leucine rich repeat containing 38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC38, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38-201ENST00000376085 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 FBXO41Q8TF61 875 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 POLLQ9UGP5 575 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 BRD1O95696 1058 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 GJB2P29033 226 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 EVX2Q03828 476 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF213O14771 459 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 ANTXR2P58335 489 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 XDHP47989 1333 aa20.24■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 UFL1O94874 794 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 JAK2O60674 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 MECOMQ03112 1051 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 MCTP1Q6DN14 999 aa20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 CACNA1SQ13698 1873 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SYT1P21579 422 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SRGNP10124 158 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 FGD1P98174 961 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SLC15A2Q16348 729 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 NEDD4P46934 1319 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SENP2Q9HC62 589 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 TRAK2O60296 914 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 SCRN1Q12765 414 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 GBP4Q96PP9 640 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRC38-201ENST00000376085 ANKRD1Q15327 319 aa20.2■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.2■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.2■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 B4E1Z4 1266 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 PRC1O43663 620 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 UTRNP46939 3433 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 BBOX1O75936 387 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 GTF3C6Q969F1 213 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 NAPBQ9H115 298 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 RIMBP2O15034 1052 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 GGA1Q9UJY5 639 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 C6orf229H3BNL8 230 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 CTDNEP1O95476 244 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 DDX11Q96FC9 970 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 STX6O43752 255 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 CHRNA5P30532 468 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 TDO2P48775 406 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 SEMA3EO15041 775 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 ALX1Q15699 326 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 NCOA7Q8NI08 942 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 CD209Q9NNX6 404 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 MTMR6Q9Y217 621 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 FOSBP53539 338 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 MCM5P33992 734 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRC38-201ENST00000376085 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms