RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 WDR62O43379 1518 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 LMAN1P49257 510 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 CPA1P15085 419 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB4BP68371 445 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 NEK11Q8NG66 645 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 IFNKQ9P0W0 207 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 GNPATO15228 680 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 KRT222Q8N1A0 295 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 ELP1O95163 1332 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PDE8AO60658 829 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 MYL5Q02045 173 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 SGSM2O43147 1006 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN1Q04323 297 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA2P54652 639 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 TEX11Q8IYF3 940 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 B4E1Z4 1266 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 SLC27A2O14975 620 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 DEXIO95424 95 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R2P41236 205 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 ARID5AQ03989 594 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PZPP20742 1482 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 RIMBP2O15034 1052 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 NF2P35240 595 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 CNBD1Q8NA66 436 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 XAGE2Q96GT9 111 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GVL5 298 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC77Q9BR77 488 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 CNGA4Q8IV77 575 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 LGR6Q9HBX8 967 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 JAG2Q9Y219 1238 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 PLCD1P51178 756 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 MCM6Q14566 821 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 GPAA1O43292 621 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ORAI2Q96SN7 254 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D4AQ9H788 454 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA1Q92805 767 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 USP19O94966 1318 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 LETM2Q2VYF4 491 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 GCKRQ14397 625 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 TUBBP07437 444 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF174Q15697 407 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ANO1Q5XXA6 986 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 SV2BQ7L1I2 683 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 CERS3Q8IU89 383 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC2Q92887 1545 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 A1BGP04217 495 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 LPIN2Q92539 896 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 PLS1Q14651 629 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2A1O14983 1001 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 SUCLG2Q96I99 432 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PRG0 241 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 OPA1O60313 960 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 RGS22Q8NE09 1264 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 FAM227BQ96M60 508 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ARMT1Q9H993 441 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS12P58397 1594 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 UFL1O94874 794 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 PLIN2Q99541 437 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 POLD1P28340 1107 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R5BQ15173 497 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-203ENST00000366687 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms