RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 H0YIN7 160 aa11.7□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CERS3Q8IU89 383 aa11.7□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.7□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 C8orf34Q49A92 452 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 USP26Q9BXU7 913 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 FSD2A1L4K1 749 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SHTN1A0MZ66 631 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CHD1O14646 1710 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 BICDL2A1A5D9 508 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 GPAA1O43292 621 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SKILP12757 684 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 USP19O94966 1318 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ATL3Q6DD88 541 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ARMT1Q9H993 441 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TAF5LO75529 589 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 MAP3K9P80192 1104 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SYT1P21579 422 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SP4Q02446 784 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 LETM2Q2VYF4 491 aa11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PRDM1O75626 825 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SUCLG2Q96I99 432 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PICK1Q9NRD5 415 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 DEXIO95424 95 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CPA1P15085 419 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PTGS1P23219 599 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PDE6BP35913 854 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PRPHP41219 470 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 STX17P56962 302 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC42Q96M95 316 aa11.67□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PZPP20742 1482 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TYRO3Q06418 890 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TCIRG1Q13488 830 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TACC1O75410 805 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 RPS6KB1P23443 525 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ARID5AQ03989 594 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CEP135Q66GS9 1140 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 FAM212AQ96EL1 285 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 KDM6BO15054 1643 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 KIF5AQ12840 1032 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 HOOK2Q96ED9 719 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PLIN2Q99541 437 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 SGSM2O43147 1006 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CA8P35219 290 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 KRT83P78385 493 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 UBE4AQ14139 1066 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF174Q15697 407 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 AOX1Q06278 1338 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-202ENST00000366197 ALDH1B1P30837 517 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms