RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.98□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 GJB2P29033 226 aa14.98□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.98□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 RXRBP28702 533 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 AIDAQ96BJ3 306 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 NBPF3Q9H094 633 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 TCHHQ07283 1943 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 APOBRQ0VD83 1088 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 LCORLQ8N3X6 602 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.97□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 JAK2O60674 1132 aa14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 BRD1O95696 1058 aa14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 MAP3K12Q12852 859 aa14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 OLFM4Q6UX06 510 aa14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 RAI14Q9P0K7 980 aa14.96□□□□□ -0.01
GGPS1-202ENST00000358966 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ADRA2BP18089 450 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SYT1P21579 422 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 FOSBP53539 338 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 UBE4AQ14139 1066 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF384Q8TF68 577 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 KRT32Q14532 448 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 UBE3CQ15386 1083 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 MRE11P49959 708 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 DDX11Q96FC9 970 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 DOCK2Q92608 1830 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CYP7A1P22680 504 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 PRDX5P30044 214 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.94□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 EVX2Q03828 476 aa14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GRAPQ13588 217 aa14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 FERMT3Q86UX7 667 aa14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF213O14771 459 aa14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 RGL2O15211 777 aa14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 STX6O43752 255 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ANTXR2P58335 489 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SCRN1Q12765 414 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ST5P78524 1137 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SENP2Q9HC62 589 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 NEDD4P46934 1319 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.92□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 B4E1Z4 1266 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GPSM2P81274 684 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GRIK5Q16478 980 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 AKT1S1Q96B36 256 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 RXRAP19793 462 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 OFD1O75665 1012 aa14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 ANKRD1Q15327 319 aa14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 GTF3C6Q969F1 213 aa14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 PRC1O43663 620 aa14.9□□□□□ -0.02
GGPS1-202ENST00000358966 MMP10P09238 476 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms