RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 GMNNO75496 209 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NOX5Q96PH1 765 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MAP7Q14244 749 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MCTP2Q6DN12 878 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DEXIO95424 95 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DCTPP1Q9H773 170 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PPP2R5EQ16537 467 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TIGD1Q96MW7 591 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 BIN1O00499 593 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 IFT74Q96LB3 600 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GPTP24298 496 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K9P80192 1104 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 UBXN1Q04323 297 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RUFY3Q7L099 469 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 AK9Q5TCS8 1911 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 WDR44Q5JSH3 913 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CLCN1P35523 988 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 INF2Q27J81 1249 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TYRO3Q06418 890 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NUP58Q9BVL2 599 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 HDXQ7Z353 690 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SKAP1Q86WV1 359 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 EBAG9O00559 213 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PDE6BP35913 854 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LIN9Q5TKA1 542 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 HAND2P61296 217 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SV2BQ7L1I2 683 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS2O95450 1211 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA0232Q92628 1395 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 KDM5CP41229 1560 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP58Q5T655 872 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 DNA2P51530 1060 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 MXRA7P84157 204 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC6Q16204 474 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PP64 1363 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 H0YCG3 227 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP157Q5JU67 520 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 CNBD1Q8NA66 436 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 FLOT1O75955 427 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 GUCY1B3Q02153 619 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 COPS6Q7L5N1 327 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 USP48Q86UV5 1035 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-201ENST00000356100 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.75□□□□□ -1.33
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