RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 PI16Q6UXB8 463 aa24.97■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.97■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF202O95125 648 aa24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPN14Q15678 1187 aa24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.96■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 CMA1P23946 247 aa24.95■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 TPM4P67936 248 aa24.95■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
PTDSS1-201ENST00000337004 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CDKL5O76039 1030 aa24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ADD2P35612 726 aa24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 MCAMP43121 646 aa24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CCZ1BP86790 482 aa24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF28PB7ZC32 967 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 STARD3NLO95772 234 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 BRINP3Q76B58 766 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF592Q92610 1267 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 PAPPAQ13219 1627 aa24.94■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ITGA6P23229 1130 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NLRP12P59046 1061 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ZMYM6O95789 1325 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.583e-6■■□□□ 12.3
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC39A14Q15043 492 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 KCND1Q9NSA2 647 aa24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 USP27XA6NNY8 438 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 APPP05067 770 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 EVA1CP58658 441 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 UBE3CQ15386 1083 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ALG1Q9BT22 464 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 PFKFB1P16118 471 aa24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 CBX1P83916 185 aa24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
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PTDSS1-201ENST00000337004 STRN4Q9NRL3 753 aa24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NEDD4P46934 1319 aa24.91■■□□□ 1.58
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PTDSS1-201ENST00000337004 GREM2Q9H772 168 aa24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 SMC2O95347 1197 aa24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 JMYQ8N9B5 988 aa24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 TIGD1Q96MW7 591 aa24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NBPF3Q9H094 633 aa24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 BIN1O00499 593 aa24.89■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 NLRP10Q86W26 655 aa24.89■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.89■■□□□ 1.58
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 CTSWP56202 376 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 SYNE4Q8N205 404 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM87BQ96K49 555 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 FEZ1Q99689 392 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 IFNKQ9P0W0 207 aa24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP6R2O75170 966 aa24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 GPTP24298 496 aa24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 SYKP43405 635 aa24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT40Q6A162 431 aa24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 VPS37DQ86XT2 251 aa24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE8BO95263 885 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 HLFQ16534 295 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PIGBQ92521 554 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 ATRNO75882 1429 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 NRDCO43847 1150 aa24.87■■□□□ 1.57
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