RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CHST3Q7LGC8 479 aa16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TPM1P09493 284 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 PFKFB1P16118 471 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 FANCCQ00597 558 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 SLC39A14Q15043 492 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 WASHC4Q2M389 1173 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 OSBP2Q969R2 916 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 A0A087WWV3 80 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CCDC66A2RUB6 948 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 PPP6R2O75170 966 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 HOMER1Q86YM7 354 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 APPBP2Q92624 585 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.01■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 UBR2Q8IWV8 1755 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 SLFN14P0C7P3 912 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 SYKP43405 635 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TRDNQ13061 729 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 NCAPHQ15003 741 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TERF2Q15554 542 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CCDC93Q567U6 631 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 OLFM4Q6UX06 510 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 SYT10Q6XYQ8 523 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TUBE1Q9UJT0 475 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.154e-6■■■□□ 15.3
MKS1-201ENST00000313863 NEDD4P46934 1319 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CPDO75976 1380 aa16■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ZNF213O14771 459 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CYP27B1O15528 508 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 MYL5Q02045 173 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 A0A0G2JLW4 131 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ZSCAN12O43309 604 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 LRRC24Q50LG9 513 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 38.5
MKS1-201ENST00000313863 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ZMYM6O95789 1325 aa15.99■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 BIN1O00499 593 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 FGAP02671 866 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 SERPINC1P01008 464 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 UBASH3AP57075 661 aa15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 PPFIA3O75145 1194 aa15.97■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 HAND2P61296 217 aa15.97■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 HPSEQ9Y251 543 aa15.97■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 NBPF26B4DH59 902 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CUTAO60888 179 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TRIM29Q14134 588 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 NBPF14Q5TI25 921 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 NBPF15Q8N660 670 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 MNS1Q8NEH6 495 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 UBXN4Q92575 508 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 XAGE2Q96GT9 111 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ANTXR2P58335 489 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ALG1Q9BT22 464 aa15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 KIF28PB7ZC32 967 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CFAP100Q494V2 611 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 RESP18Q5W5W9 173 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 VSTM4Q8IW00 320 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TMX1Q9H3N1 280 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 DNAI1Q9UI46 699 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ARHGAP6O43182 974 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 GPAA1O43292 621 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ATP8B1O43520 1251 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CCDC102BQ68D86 513 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms