RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.56■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 PGBD1Q96JS3 809 aa25.56■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.56■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 CDC25BP30305 580 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 LUZP1Q86V48 1076 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 JAK2O60674 1132 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 OSBP2Q969R2 916 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.55■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.54■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF75DP51815 510 aa25.54■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.54■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 SPC24Q8NBT2 197 aa25.54■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 NYXQ9GZU5 481 aa25.54■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 M0R2C6 588 aa25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 ZMYND15Q9H091 742 aa25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 NR1I2O75469 434 aa25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 WASHC4Q2M389 1173 aa25.53■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 KCNQ4P56696 695 aa25.52■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 SCRN1Q12765 414 aa25.52■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.52■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.52■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 LAMA4Q16363 1823 aa25.52■■□□□ 1.68
C6orf136-201ENST00000293604 PHKA1P46020 1223 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF165P49910 485 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ERFEQ4G0M1 354 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 GNPATO15228 680 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ZPR1O75312 459 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 PTGS1P23219 599 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SARM1Q6SZW1 724 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 PI16Q6UXB8 463 aa25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ADD2P35612 726 aa25.5■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 UBE3CQ15386 1083 aa25.5■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 CASZ1Q86V15 1759 aa25.5■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 TRIM5Q9C035 493 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 FGD1P98174 961 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 FBXL16Q8N461 479 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SETDB2Q96T68 719 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 C4BP0C0L5 1744 aa25.49■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.48■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.48■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.48■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 CHRNDQ07001 517 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 FAM182BQ5T319 152 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 DOCK2Q92608 1830 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 STX1AQ16623 288 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 SPATA5Q8NB90 893 aa25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 NEMFO60524 1076 aa25.46■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 DRC7Q8IY82 874 aa25.46■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 A0A1B0GUL6 1792 aa25.46■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.45■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 DDX11Q96FC9 970 aa25.45■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.45■■□□□ 1.67
C6orf136-201ENST00000293604 E7EWF7 191 aa25.45■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 GPAA1O43292 621 aa25.45■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.45■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 C4AP0C0L4 1744 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 IQCB1Q15051 598 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 SYCP1Q15431 976 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 CTDNEP1O95476 244 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 RASGRF1Q13972 1273 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
C6orf136-201ENST00000293604 FOXP2O15409 715 aa25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms