RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292377.3

GPC2-201, Transcript of glypican 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC2, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2-201ENST00000292377 KLRK1P26718 216 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 LCORLQ8N3X6 602 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ABCF2Q9UG63 623 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 LIG1P18858 919 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 RXRAP19793 462 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SETDB2Q96T68 719 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ZPR1O75312 459 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SPATA32Q96LK8 384 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 NEDD4P46934 1319 aa21.47■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.47■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 EVCP57679 992 aa21.47■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 LAMB2P55268 1798 aa21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.46■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SMIM22K7EJ46 135 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 TRDNQ13061 729 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 FBXL16Q8N461 479 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 KDM4AO75164 1064 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CAMK4Q16566 473 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 PGBD1Q96JS3 809 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 NAPBQ9H115 298 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 HSPA1LP34931 641 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 AFF2P51816 1311 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CYP7A1P22680 504 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 NLRP3Q96P20 1036 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 MYL10Q9BUA6 226 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 RAI14Q9P0K7 980 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CASZ1Q86V15 1759 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.43■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 JAG2Q9Y219 1238 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ELP1O95163 1332 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 DOCK2Q92608 1830 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 VPS37DQ86XT2 251 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.42■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.41■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 UBE4AQ14139 1066 aa21.41■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 AIFM3Q96NN9 605 aa21.41■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.41■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 TDO2P48775 406 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 DACT1Q9NYF0 836 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 NPHP1O15259 732 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ALX1Q15699 326 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ZNF384Q8TF68 577 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 USP28Q96RU2 1077 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 SCN7AQ01118 1682 aa21.4■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CPLX1O14810 134 aa21.39■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 RFC4P35249 363 aa21.39■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.39■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 MICU3Q86XE3 530 aa21.39■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.39■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 NYXQ9GZU5 481 aa21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.5 ms