RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 TERF1P54274 439 aa24.56■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHRNDQ07001 517 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.55■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCF2Q9UG63 623 aa24.55■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOMM22Q9NS69 142 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGFR2P21802 821 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.521e-17■■■■■ 27.7
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UBE2Q1-201ENST00000292211 VPS37DQ86XT2 251 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.53■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 MBD4O95243 580 aa24.52■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 CAMK4Q16566 473 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
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UBE2Q1-201ENST00000292211 BICD2Q8TD16 824 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARMT1Q9H993 441 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTDNEP1O95476 244 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.51■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SPEF2Q9C093 1822 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 EP400Q96L91 3159 aa24.51■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.48■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SETDB2Q96T68 719 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.48■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 RAI14Q9P0K7 980 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 LIG1P18858 919 aa24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 TDO2P48775 406 aa24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.47■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 LAMA4Q16363 1823 aa24.47■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.46■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.46■■□□□ 1.51
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UBE2Q1-201ENST00000292211 DACT1Q9NYF0 836 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP45Q9UL16 551 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.44■■□□□ 1.5
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